Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP3O75386 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP3O75386 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP3O75386 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP3O75386 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP3O75386 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP3O75386 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP3O75386 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP3O75386 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP3O75386 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP3O75386 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP3O75386 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TULP3O75386 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms