Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNCRIPO60506 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms