Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KIF1CO43896 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIF1CO43896 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms