Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP9BO43861 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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