Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATCO43716 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATCO43716 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GATCO43716 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GATCO43716 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATCO43716 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATCO43716 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATCO43716 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms