Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K13O43283 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K13O43283 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms