Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP26A1O43174 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP26A1O43174 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP26A1O43174 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP26A1O43174 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP26A1O43174 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP26A1O43174 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP26A1O43174 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP26A1O43174 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP26A1O43174 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms