Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF113AO15541 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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