Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC5O15511 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms