Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLRMTO00411 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms