Protein–RNA interactions for Protein: A8MTL9

HMSD, Serpin-like protein HMSD, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMSDA8MTL9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HMSDA8MTL9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMSDA8MTL9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms