Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms