Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALM3A6NDB9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms