Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL33A6NCF5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL33A6NCF5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms