Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf49A4QMS7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf49A4QMS7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms