Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms