Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TCRBV5S1A1TA0A578 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S1A1TA0A578 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S1A1TA0A578 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCRBV5S1A1TA0A578 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRBV5S1A1TA0A578 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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TCRBV5S1A1TA0A578 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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