Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC007652.1-201ENST00000441150 562 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL590396.1-201ENST00000450208 775 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL020994.1-201ENST00000454387 578 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 LINC00370-201ENST00000455487 698 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RPL34P17-201ENST00000472160 347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC112249.1-201ENST00000513916 436 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TSC22D3-216ENST00000514426 569 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ELOCP22-201ENST00000529735 334 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AP003059.2-201ENST00000532979 503 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC025578.1-201ENST00000552027 543 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC119044.1-201ENST00000553227 404 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL358335.1-201ENST00000555388 1066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL121809.1-201ENST00000556389 849 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC010931.1-201ENST00000565063 386 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC137761.1-201ENST00000569859 601 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MIR3190-201ENST00000577414 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 BOD1P2-201ENST00000578494 481 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC008013.3-201ENST00000605711 675 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 FAM122B-208ENST00000611027 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 U1.30-201ENST00000622285 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 GULP1-201ENST00000359135 3347 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PBRM1-201ENST00000296302 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PTGS1-206ENST00000614910 4894 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 BTD-206ENST00000437172 2097 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RBMY1A1-204ENST00000439108 1879 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 KDM4D-201ENST00000335080 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TRIM51-202ENST00000449290 1629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PRUNE1-203ENST00000368935 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 GDAP1-201ENST00000220822 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ADGRG1-267ENST00000568909 4254 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 XRCC6-203ENST00000402580 2006 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SOX13-210ENST00000618875 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 DCTN1-AS1-206ENST00000437991 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 BABAM2-202ENST00000344773 1852 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZNF154-202ENST00000512439 5687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AP002847.1-201ENST00000625136 2245 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 VPS50-201ENST00000251739 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MYL4-201ENST00000354968 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SH3BGR-204ENST00000380637 1014 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 NMNAT1-202ENST00000403197 1094 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL391416.1-201ENST00000403475 994 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL133415.1-201ENST00000456355 706 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RPSAP47-201ENST00000479228 888 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RPSAP29-201ENST00000483479 869 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SOX2-OT-215ENST00000493521 1239 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC112240.1-201ENST00000511007 394 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC013643.1-201ENST00000518155 310 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC107918.1-201ENST00000528715 967 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AP003031.2-201ENST00000533945 573 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL662844.2-201ENST00000538455 284 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC007610.3-201ENST00000566879 934 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC036176.2-201ENST00000589763 1153 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC006115.3-201ENST00000594400 560 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 HP-218ENST00000613898 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.160-201ENST00000622203 277 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SOX2-OT-244ENST00000627738 692 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC137936.1-201ENST00000636316 845 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 BTN2A2-201ENST00000352867 3241 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ATP8A2-201ENST00000255283 3287 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 THUMPD1-202ENST00000396083 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZIC4-201ENST00000383075 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AP003716.1-202ENST00000511677 3387 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZC4H2-201ENST00000337990 2363 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 UHRF2P1-201ENST00000431339 2387 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PFKM-225ENST00000551804 2797 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 VPS18-201ENST00000220509 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 INPP5F-201ENST00000361976 5063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RNF2-202ENST00000367510 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 CTCFL-216ENST00000608263 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 BUD13P1-201ENST00000603676 1489 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SOX9-AS1-204ENST00000434703 3032 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 HAL-203ENST00000541929 3846 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 DENND5B-203ENST00000536562 4291 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MAGED1-204ENST00000375772 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 LRRC37A3-201ENST00000319651 5537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ACAN-208ENST00000561243 7593 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ALDH1L1-203ENST00000393434 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 FCRLA-208ENST00000367953 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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