Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC61Q9Y6R9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC61Q9Y6R9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms