Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms