Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NCOA3Q9Y6Q9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA3Q9Y6Q9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms