Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN6Q9Y6Q1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN6Q9Y6Q1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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