Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX9Q9Y5X1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms