Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX10Q9Y5X0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX10Q9Y5X0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX10Q9Y5X0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX10Q9Y5X0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX10Q9Y5X0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms