Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms