Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB2Q9Y5E7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB2Q9Y5E7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms