Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PAXBP1Q9Y5B6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms