Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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NFE2L3Q9Y4A8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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NFE2L3Q9Y4A8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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NFE2L3Q9Y4A8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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NFE2L3Q9Y4A8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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NFE2L3Q9Y4A8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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NFE2L3Q9Y4A8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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NFE2L3Q9Y4A8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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NFE2L3Q9Y4A8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
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