Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms