Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX24Q9Y343 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms