Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YBX2Q9Y2T7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms