Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms