Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNEQ9Y223 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms