Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH4Q9UQ05 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH4Q9UQ05 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms