Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms