Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG5Q9UPR3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG5Q9UPR3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG5Q9UPR3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG5Q9UPR3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG5Q9UPR3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG5Q9UPR3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG5Q9UPR3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG5Q9UPR3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms