Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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