Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms