Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIZ1Q9ULV3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIZ1Q9ULV3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms