Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms