Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms