Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms