Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2LQ9UL33 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms