Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms