Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms