Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms