Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCTN4Q9UJW0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms