Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms