Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms