Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH4Q9UIA0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms